研讨提醒酿酒酵母基因组结构图谱—小柯机器人—科学网
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法国索邦大学Gilles Fischer、Joseph Schacherer和蔚蓝海岸大学Gianni Liti研讨团队协作在研讨中获得发展。他们使用142株菌株端粒到端粒的拼装提醒了酿酒酵母基因组结构景象。相关论文宣布在2023年7月31日出书的《天然-遗传学》杂志上。
研讨人员重塑了酿酒酵母参阅拼装小组（ScRAP），包含142种代表该物种系统发育和生态多样性的参阅基因组。ScRAP包含几种杂合二倍体和多倍体别离株的相相单倍体拼装。研讨人员发现了约4，800个非冗余SV，它们供给了基因组多样性的广泛图谱，包含端粒长度和转座元件动态。研讨提醒了杂乱非整倍体的呈现频率，其中大染色体阅历了大片段缺失和易位。
研讨人员发现SVs能够影响断点邻近的基因表达，并对基因库进化做出了实质性奉献。研讨还发现染色体结尾存在水平区域刺进并能够发生新的端粒。整体而言，ScRAP证明了泛基因组在了解种群规划基因组进化方面的好处。
据介绍，泛基因组为在序列多态性和结构变异（SV）水平对物种遗传多样性精确表征供给了途径。
